AffyCompatible

DOI:10.18129 / B9.bioc.AffyCompatible

这个包裹是弃用.它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。

Affymetrix基因芯片软件兼容性

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该包提供了到Affymetrix芯片注释和示例属性文件的接口。该包允许用户轻松下载和管理Affynmetrix netafffx注释文件的本地数据库。该包还提供了对GeneChip操作系统(GCOS)和GeneChip命令控制台(AGCC)兼容的示例注释文件的访问。

作者:马丁·摩根,罗伯特·绅士

维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>

引文(从R内,输入引用(“AffyCompatible”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“AffyCompatible”)

PDF R脚本 使用netafxresource进行注释检索
PDF R脚本 检索MAGE和ARR样本属性
PDF 参考手册

细节

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版本 1.58.0
在Bioconductor BioC 2.2 (R-2.7)(14.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.7.0),XML(> = 2.8 1),RCurl(>= 0.8-1),方法
进口 Biostrings
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 AffyCompatible_1.58.0.tar.gz
Windows二进制 AffyCompatible_1.58.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) AffyCompatible_1.58.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) AffyCompatible_1.58.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffyCompatible
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AffyCompatible
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AffyCompatible/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网