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AffiXcan
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DOI:10.18129 / B9.bioc.AffiXcan
遗传调控表达的功能方法
Bioconductor版本:发行版(3.13)
利用基于总结合亲和力(TBA)的方法，为个体样本中的一组基因输入一个GReX(基因调控表达)。输入GReX的统计模型可以用一个已知真实总表达式值的训练数据集进行训练。
作者:Alessandro Lussana [aut, cre]
维护者:Alessandro Lussana < Alessandro。Lussana在protonmail.com>
引文(从R内，输入引用(“AffiXcan”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("AffiXcan")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“AffiXcan”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | AffiXcan |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，SummarizedExperiment |
| 进口 | MultiAssayExperiment，BiocParallel，蜡笔 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | AffiXcan_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | AffiXcan_1.10.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | AffiXcan_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffiXcan |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AffiXcan |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AffiXcan/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
