分配

DOI：10.18129 / b9.bioc.assign.

自适应签名选择和集成（分配）

Bioconductor版本：释放（3.13）

分配是一个计算工具，用于评估各个患者样本中的路径放松管制/激活状态。分配采用灵活的贝叶斯因子分析方法，适应从基于知识的文献或从扰动实验到细胞/组织特异性途径签名的预定途径签名。将每个上下文的途径的放松定量/激活水平量化为分数，这表示患者样本包括通路放松管制/激活签名的程度。

作者：英文，安德里亚·贝尔，W. Evan Johnson和Mumtehena Rahman

维护者：英文，W. Evan Johnson ，David Jenkins ，Mumtehena Rahman

安装

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if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“分配”）

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文件

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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.28.0
在生物导体中以来	BIOC 2.14（R-3.1）（7年）
执照	mit +文件执照
依靠	r（> = 3.4）
进口	贡献，图形，grdevices，MSM那rlab.，统计，SVA.，实用，ggplot2.那yaml.
链接到
建议	testthat.那生物焦那林德里那kn那RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.	https://compbiomed.github.io/assign/
Bugreports.	https://github.com/compbiomed/assign/issues.
取决于我
进口我	TBSignatureProfiler.
建议我
链接给我
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包档案包

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源包	Assign_1.28.0.tar.gz.
Windows二进制文件	assign_1.28.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	Assign_1.28.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/assign.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/分配
包短网址	https://biocumon.org/packages/assign/
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