APL

DOI:10.18129 / B9.bioc.APL

协会的情节

Bioconductor版本:版本(3.15)

APL是一个包为计算协会的情节(美联社),开发一种方法单细胞转录组数据的可视化和分析。APL的主要焦点是单个集群基因的鉴定特征的细胞从输入数据。包执行对应分析(CA),并允许识别提供集群范围内的基因利用协会的情节。此外,APL计算cluster-specificity分数为所有基因可以排列的基因的特异性选择感兴趣的细胞集群。

作者:Elzbieta Gralinska (cre, aut],克莱门斯科尔(aut),马丁Vingron (aut)

维护人员:Elzbieta Gralinska < Gralinska在molgen.mpg.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(APL)

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文档

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(< 6个月)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 4.2)
进口	网状,ggrepel,ggplot2,viridisLite,情节,修拉,SingleCellExperiment,magrittr,SummarizedExperiment,topGO、方法、统计跑龙套,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,rlang
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,scRNAseq,嘘,食物,testthat
SystemRequirements	python、pytorch numpy
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	APL_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	APL_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	APL_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/APL
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ APL
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/APL/
包下载报告	下载数据