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AMOUNTAIN
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DOI:10.18129 / B9.bioc.AMOUNTAIN
积极为多层加权基因co-expression网络模块:一个连续优化的方法
Bioconductor版本:版本(3.16)
纯数据驱动基因网络,加权基因co-expression网络(WGCN)只能从构建表达谱。不同的层在这种网络可能代表不同的时间点,多个条件或不同的物种。在多层WGCN AMOUNTAIN旨在搜索活动模块使用一个连续的优化方法。
作者:李董,他掸,Zhisong锅和谷雨胡
维护人员:李董< dxl466在cs.bham.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“AMOUNTAIN”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AMOUNTAIN”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“AMOUNTAIN”)
| HTML | R脚本 | 装饰图案的标题 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.3.0) |
| 进口 | 统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,qgraph,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | gsl |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 这种款式 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | AMOUNTAIN_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | AMOUNTAIN_1.24.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | AMOUNTAIN_1.24.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | AMOUNTAIN_1.24.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AMOUNTAIN |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AMOUNTAIN |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/AMOUNTAIN/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AMOUNTAIN/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
