AMOUNTAIN

DOI:10.18129 / B9.bioc.AMOUNTAIN

积极为多层加权基因co-expression网络模块:一个连续优化的方法

Bioconductor版本:版本(3.16)

纯数据驱动基因网络,加权基因co-expression网络(WGCN)只能从构建表达谱。不同的层在这种网络可能代表不同的时间点,多个条件或不同的物种。在多层WGCN AMOUNTAIN旨在搜索活动模块使用一个连续的优化方法。

作者:李董,他掸,Zhisong锅和谷雨胡

维护人员:李董< dxl466在cs.bham.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“AMOUNTAIN”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AMOUNTAIN”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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细节

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版本 1.24.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.3.0)
进口 统计数据
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建议 BiocStyle,qgraph,knitr,rmarkdown
SystemRequirements gsl
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 AMOUNTAIN_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 AMOUNTAIN_1.24.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) AMOUNTAIN_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) AMOUNTAIN_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AMOUNTAIN
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AMOUNTAIN
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/AMOUNTAIN/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AMOUNTAIN/
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