高手

doi:10.18129/b9.bioc.ace

低覆盖层整个基因组测序的绝对拷贝数估计

生物导体版本:版本(3.15)

使用分段的拷贝数数据来估计肿瘤细胞百分比,并产生显示绝对副本编号的副本编号图。

作者:Jos B Poell

维护者:Jos B Poell

引用(从r内,输入引用(“ Ace”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ ACE”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Ace”)

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文本 消息

细节

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版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(3.5岁)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.4)
进口 生物酶,,,,QDNASEQ,,,,GGPLOT2,网格,统计,utils,方法,grdevices,基因组机
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/tgac-vumc/ace
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ace_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 ace_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) ace_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ace
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/王牌
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ace/
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