ABSSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.ABSSeq

ABSSeq:一种新的基于绝对表达差异建模的RNA-Seq分析方法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

通过两组之间的绝对计数差异推断差异表达基因,利用负二项分布,根据表达水平间分散的异质性调节折叠变化。

作者:杨文涛

维护者:杨文涛

引文(从R内,输入引用(“ABSSeq”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ABSSeq”)

PDF R脚本 ABSSeq
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 1.52.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(9年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R(>= 2.10),方法
进口 locfitlimma
链接
建议 刨边机
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 metaseqR2
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ABSSeq_1.52.0.tar.gz
Windows二进制 ABSSeq_1.52.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) ABSSeq_1.52.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) ABSSeq_1.52.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ABSSeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ABSSeq
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ABSSeq/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ABSSeq/
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