qsvaR

DOI:10.18129 / B9.bioc.qsvaR

生成退化校正的质量替代变量分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

qsvaR包包含用于消除死后脑组织rna-seq数据降解影响的功能。该软件包用于帮助用户生成与降级相关的主组件。该组分可用于差异表达分析，以消除降解的影响。

作者:Joshua Stolz [aut, cre]，李奥纳多·科拉多-托雷斯[ctb]

维护者:Joshua Stolz

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“qsvaR”)

超文本标记语言	R脚本	qsvaR介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion,报道,DifferentialExpression,归一化,测序,软件,WorkflowStep
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.2)，SummarizedExperiment
进口	股东价值分析统计数据,ggplot2、方法
链接
建议	BiocFileCache,BiocStyle,covr,knitr,limma,RefManageR,rmarkdown,sessioninfo,testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LieberInstitute/qsvaR
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/qsvaR
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	qsvaR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	qsvaR_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	qsvaR_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	qsvaR_1.1.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qsvaR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qsvaR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/qsvaR/
软件包下载报告	下载数据