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qmtools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.qmtools
定量代谢组学数据处理工具
Bioconductor版本:发行版(3.16)
qmtools(定量代谢组学工具)包提供了使用标准summarizeexperiment类处理定量代谢组学数据的基本工具。这包括用于归一化、特征过滤、特征聚类、降维和可视化的功能，以帮助用户准备用于统计分析的数据。这个包中的几个函数也可以用于其他类型的组学数据。
作者:Jaehyun Joo [aut, cre]， Blanca Himes [aut]
维护者:Jaehyun Joo
引文(从R内，输入引用(“qmtools”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“qmtools”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 定量代谢组学数据处理 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DimensionReduction，MassSpectrometry，代谢组学，归一化，预处理，软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.2.0)，SummarizedExperiment |
| 进口 | rlang，ggplot2，拼接而成，的热图、方法、MsCoreUtils统计数据,igraph，VIM，尺度， grDevices，图形 |
| 链接 | |
| 建议 | limma，Rtsne，missForest，vsn，pcaMethods，请，MsFeatures，嫁祸于，imputeLCMD，nlme，testthat(> = 3.0.0),BiocStyle，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/HimesGroup/qmtools |
| BugReports | https://github.com/HimesGroup/qmtools/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | qmtools_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | qmtools_1.2.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | qmtools_1.2.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | qmtools_1.1.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qmtools |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qmtools |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qmtools/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
