plyranges

DOI:10.18129 / B9.bioc.plyranges

一个操纵GenomicRanges连贯接口

Bioconductor版本:版本(3.16)

dplyr-like界面相互作用的范围和GenomicRanges共同Bioconductor类。通过提供一个语法和一致的方式操纵这些类为新Bioconductor accessiblity用户是希望增加。

作者:斯图亚特·李(aut (cre)迈克尔·劳伦斯(aut,施莱)Dianne库克(aut,施莱),斯宾塞Nystrom(施)

维修工:斯图亚特·李< stuart.andrew。李在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“plyranges”)

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文档

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细节

biocViews	报道,DataRepresentation,基础设施,软件,WorkflowStep
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),BiocGenerics,IRanges(> = 2.12.0),GenomicRanges(> = 1.28.4)
进口	方法,dplyr,rlang(> = 0.2.0),magrittr,tidyselect(> = 1.0.0),rtracklayer,GenomicAlignments,GenomeInfoDb,Rsamtools,S4Vectors(> = 0.23.10),跑龙套
链接
建议	knitr,BiocStyle,rmarkdown,testthat(> =魅惑,HelloRanges,HelloRangesData,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,pasillaBamSubset,covr,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/sa-lee/plyranges
取决于我
进口我	BOBaFIT,BUSpaRse,cfDNAPro,dasper,fluentGenomics,InPAS,katdetectr,methylCC,multicrispr,nearBynding,nullranges,plotgardener
建议我	CTCF,EpiCompare,extraChIPs,模因,svaNUMT,svaRetro
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	plyranges_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	plyranges_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	plyranges_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	plyranges_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ plyranges
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/plyranges/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/plyranges/
包下载报告	下载数据