地球
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DOI:10.18129 / B9.bioc.planet
胎盘DNA甲基化分析工具
Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包包含R函数来推断额外的生物变量，以补充胎盘数据的DNA甲基化分析。这包括从胎盘DNA甲基化阵列(450k/850k)数据推断种族/血统、胎龄和细胞组成。该软件包附带一个经过处理的胎盘数据集示例。
作者:Victor Yuan [aut, cre]， Wendy P. Robinson [ctb]
维护者:Victor Yuan < Victor。2wy在gmail.com>
引文(从R内，输入引用(“行星”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("planet")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“行星”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 地球 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CpGIsland，DNAMethylation，DifferentialMethylation，表观遗传学，MethylationArray，微阵列，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 4.0) |
| 进口 | 方法,宠物猫，magrittr，dplyr |
| 链接 | |
| 建议 | ggplot2，testthat，tidyr，尺度，minfi，EpiDISH，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://victor.rbind.io/planethttp://github.com/wvictor14/planet |
| BugReports | http://github.com/wvictor14/planet/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | methylclock |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | planet_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | planet_1.6.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | planet_1.6.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | planet_1.6.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/planet |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/planet |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/planet/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/planet/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
