pRoloc

DOI:10.18129 / B9.bioc.pRoloc

空间蛋白质组学的统一生物信息学框架

Bioconductor版本:发行版(3.16)

pRoloc包实现了机器学习和可视化方法,用于定量质谱数据的分析和集成,以可靠地推断蛋白质亚细胞定位。

作者:劳伦特·盖托,奥利弗·克鲁克和丽莎·m·布雷克尔斯,托马斯·伯格和塞缪尔·维佐雷克为其提供了贡献

维护者:Laurent Gatto < Laurent。uclouvain的Gatto。be>

引用(从R中,输入引用(“pRoloc”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("pRoloc")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“pRoloc”)

超文本标记语言 R脚本 空间蛋白质组学的迁移学习算法
超文本标记语言 R脚本 标注空间蛋白质组学数据
超文本标记语言 R脚本 使用pRoloc的贝叶斯空间蛋白质组学
超文本标记语言 R脚本 pRoloc中的机器学习技术
超文本标记语言 R脚本 利用pRoloc进行空间蛋白质组学数据分析
PDF 参考手册
文本 新闻
视频 pRoloc, pRolocdata和pRolocGUI

细节

biocViews 分类聚类ImmunoOncologyMassSpectrometry蛋白质组学质量控制软件
版本 1.38.0
在Bioconductor公司 BioC 2.12 (R-3.0)(9.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.5),MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(>= 1.67.10),方法Rcpp(> = 0.10.3),BiocParallel
进口 stats4,Biobasemclust(> = 4.3),脱字符号e1071抽样kernlab晶格nnetrandomForest代理模糊神经网络hexbinBiocGenerics统计数据,dendextendRColorBrewer尺度质量knitrmvtnormLaplacesDemoncodamixtoolsgtoolsplyrggplot2biomaRt, utils, grDevices,图形
链接 RcppRcppArmadillo
建议 testthatrmarkdownpRolocdata(> = 1.9.4),roxygen2xtablerglBiocStyle(> = 2.5.19),hpar(> = 1.15.3),dplyrakima字段素食主义者GO.dbAnnotationDbiRtsne(> = 0.13),nipals重塑魔法
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lgatto/pRoloc
BugReports https://github.com/lgatto/pRoloc/issues
全靠我 bandlepRolocGUI
进口我
建议我 MSnbasepRolocdataRforProteomics
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 pRoloc_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 pRoloc_1.38.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) pRoloc_1.37.1.tgz
macOS二进制文件(arm64) pRoloc_1.37.1.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/pRoloc
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pRoloc
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/pRoloc/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网