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omicsPrint
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DOI:10.18129 / B9.bioc.omicsPrint
十字架使基因指纹分析
Bioconductor版本:版本(3.17)
omicsPrint提供了交叉功能使遗传指纹分析,例如,来验证样品多个组学数据类型之间的关系,即基因组、转录组、表观遗传(DNA甲基化)。
作者:范Iterson (aut)戴维猫(cre)
维护人员:戴维猫< davycats。直流gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“omicsPrint”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“omicsPrint”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“omicsPrint”)
| HTML | R脚本 | omicsPrint:检测数据在多个组学研究链接错误 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DNAMethylation,表观遗传学,GeneticVariability,遗传学,ImmunoOncology,质量控制,软件,转录,转录组 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 3.5),质量 |
| 进口 | 方法、matrixStats图形,统计数据,SummarizedExperiment,MultiAssayExperiment,RaggedExperiment |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,rmarkdown knitr testthat,GEOquery,VariantAnnotation,Rsamtools,BiocParallel,GenomicRanges,FDb.InfiniumMethylation.hg19,snpStats |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | omicsPrint_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | omicsPrint_1.20.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | omicsPrint_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | omicsPrint_1.19.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicsPrint |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ omicsPrint |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/omicsPrint/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/omicsPrint/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
