multiSight

DOI:10.18129 / B9.bioc.multiSight

多组学分类、功能丰富和网络推理分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

multiSight是一个R包，提供基于Stouffer的p值池和多块统计方法以多组学方式分析组学数据集的功能。对于您提供的每个omic数据集，multiSight提供了具有特征选择的分类模型，您可以将其用作生物特征:(i)预测表型(例如诊断任务，组织学分型)，(ii)设计路径和基因本体丰富(过度表示分析)，(iii)构建连接到PubMed查询的网络推理，使假设更容易和数据驱动。主要分析是嵌入在一个用户友好的图形界面。

作者:Florian Jeanneret [cre, aut]，斯蒂芬·加古特[au]

维护者:Florian Jeanneret < Florian。Jeanneret在cea.fr>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“multiSight”)

超文本标记语言	R脚本	multiSight快速启动指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，DifferentialExpression，GeneSetEnrichment，网络，NetworkInference，通路，RNASeq，软件，microrna的
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	CeCILL +文件许可证
取决于	R (>= 4.1)
进口	傀儡，配置，R6，闪亮的，shinydashboard，DT，dplyr，stringr，anyLib，脱字符号，biosigner，mixOmics统计数据,DESeq2，clusterProfiler，rWikiPathways，ReactomePA，enrichplot，ppcor，metap，infotheo，igraph，networkD3，easyPubMed跑龙套,htmltools，rmarkdown，ggnewscale
链接
建议	org.Mm.eg.db，rlang，减价，尝试，processx，testthat，knitr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Fjeanneret/multiSight/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	multiSight_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	multiSight_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	multiSight_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	multiSight_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiSight
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/multiSight
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/multiSight/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/multiSight/
软件包下载报告	下载数据