- 首页
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- multiGSEA
multiGSEA
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.multiGSEA
结合基于gsea的通路富集与多组学数据集成
Bioconductor版本:发行版(3.16)
从8个不同数据库(KEGG、Reactome、Biocarta等)中提取的通路特征可用于转录组、蛋白质组和/或代谢组水平，以计算基于gsea的组合富集评分。
作者:Sebastian Canzler [aut, cre]
， Jörg Hackermüller [aut]
维护者:Sebastian Canzler < Sebastian。Canzler在ufz.de>
引文(从R内，输入引用(“multiGSEA”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“multiGSEA”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | multiGSEA.html |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BioCarta，GeneSetEnrichment，通路，Reactome，软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.0.0) |
| 进口 | magrittr，石墨，AnnotationDbi，dplyr，fgsea，metap，rappdirs，rlang、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Ss.eg.db，org.Bt.eg.db，org.Ce.eg.db，org.Dm.eg.db，org.Dr.eg.db，org.Gg.eg.db，org.Xl.eg.db，org.Cf.eg.db，metaboliteIDmapping，knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat(> = 2.1.0的) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/yigbt/multiGSEA |
| BugReports | https://github.com/yigbt/multiGSEA/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | multiGSEA_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | multiGSEA_1.8.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | multiGSEA_1.8.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | multiGSEA_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiGSEA |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/multiGSEA |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/multiGSEA/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/multiGSEA/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
