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moanin
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DOI:10.18129 / B9.bioc.moanin
时间课程RNASeq数据分析的R包
Bioconductor版本:发行版(3.16)
时间过程基因表达数据的简单高效的工作流程，建立在CRAN和bioconductor上托管的公开可用的开源项目上。Moanin提供了使用函数式数据分析分析时间过程数据所需的所有步骤的辅助函数:(1)时间过程数据的函数式建模;(2)差异表达分析;(3)聚类;(4)下游分析。
作者:伊丽莎白·珀多姆
，内尔·瓦罗克[aut, cre]
维护者:Nelle Varoquaux < Nelle。Varoquaux在gmail.com>
引文(从R内，输入引用(“moanin”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“moanin”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 呻吟包 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，微阵列，RNASeq，软件，TimeCourse |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | BSD 3-clause许可+文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.0)，SummarizedExperiment，topGO,统计数据 |
| 进口 | S4Vectors，质量(> = 1.0.0),limma，冬青，刨边机，图形，方法，grDevices，reshape2，敝中断，动物园，ClusterR样条函数,matrixStats |
| 链接 | |
| 建议 | testthat(> = 1.0.0),timecoursedata，knitr，rmarkdown，减价，covr，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | moanin_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | moanin_1.6.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | moanin_1.6.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | moanin_1.6.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/moanin |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/moanin |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/moanin/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/moanin/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
