missRows

DOI:10.18129 / B9.bioc.missRows

处理缺失个人Multi-Omics数据集成

Bioconductor版本:版本(3.17)

missRows包实现了MI-MFA方法处理丢失的个人(“生物单位”)multi-omics数据集成。MI-MFA方法生成多个估算数据集的多个因子分析模型,然后产生结果,结合在一个共识的解决方案。个人包提供了估算坐标的函数和变量,将缺失的个体,和各种诊断图检查missingness和可视化的模式由于缺失值的不确定性。

作者:伊格纳西奥·冈萨雷斯和Valentin Voillet

维修工:冈萨雷斯Ignacio < Ignacio。冈萨雷斯在bbox.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“missRows”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“missRows”)

PDF	R脚本	missRows
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,MathematicalBiology,PrincipalComponent,软件,StatisticalMethod,可视化
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.5)、方法ggplot2, grDevices,MultiAssayExperiment
进口	gtools plyr,统计数据,S4Vectors
链接
建议	BiocStyle、knitr testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	missRows_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	missRows_1.20.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	missRows_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	missRows_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/missRows
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ missRows
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/missRows/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/missRows/
包下载报告	下载数据