microbiomeDataSets

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiomeDataSets

基于微生物组数据集的实验中心

Bioconductor版本:发行版(3.16)

microbiomeDataSets是Bioconductor'S ExperimentHub基础设施加载的微生物组数据集的集合。这些数据集可作为工作流程和在Bioconductor上发布的微生物组分析工具旁边的小插图的参考。额外的数据集可以随时间添加,欢迎作者的添加。

作者:Leo Lahti [cre, aut],菲利克斯·G.M.恩斯特[au], Sudarshan Shetty [au], Chouaib Benchraka [ctb], Yagmur Simsek [ctb]

维护者:Leo Lahti < Leo。拉赫蒂在iki.fi>

引文(从R内,输入引用(“microbiomeDataSets”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“microbiomeDataSets”)

超文本标记语言 R脚本 microbiomeDataSets
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubMicrobiomeDataSequencingData
版本 1.6.0
许可证 CC0
取决于 R (>= 4.1),SummarizedExperimentTreeSummarizedExperimentMultiAssayExperiment
进口 方法,跑龙套,BiocGenericsExperimentHubBiostrings
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyleSingleCellExperimenttestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 米娅miaViz
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 microbiomeDataSets_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiomeDataSets
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/microbiomeDataSets
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/microbiomeDataSets/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网