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miRmine
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DOI:10.18129 / B9.bioc.miRmine
包含miRmine数据库中的miRNA-seq数据集的数据包作为rangedsummarizeexperiment
Bioconductor版本:发行版(3.16)
miRmine数据库是来自不同公开可用的miRNA-seq数据集的表达谱集合，Panwar等人(2017)miRmine:一个人类miRNA表达数据库，用这个数据包作为rangedsummarizeexperiment准备。
作者:Dusan Randjelovic [aut, cre]
维护者:Dusan Randjelovic < Dusan。Randjelovic在sbgenomic ics.com>上说
引用(从R中，输入引用(“miRmine”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("miRmine")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“miRmine”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | miRmine |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ExpressionData，Homo_sapiens_Data，RNASeqData，SequencingData，软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL (>= 3) |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，SummarizedExperiment |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，DESeq2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | miRmine_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | miRmine_1.20.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | miRmine_1.20.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | miRmine_1.20.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/miRmine |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRmine |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miRmine/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
