Bioconductor版本:发行版(3.16)
该包旨在识别异构数据中的miRNA海绵模块。它提供了研究miRNA海绵模块的几个功能,包括流行的推断基因模块(候选miRNA海绵模块)的方法,以及识别miRNA海绵模块的功能,以及对miRNA海绵模块进行模块化分析的几个功能。
作者:张俊鹏[aut, cre]
维护人员:Junpeng Zhang
引文(从R内,输入引用(“miRSM”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“miRSM”)
超文本标记语言 | R脚本 | miRSM:在异构数据中推断miRNA海绵模块 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BiomedicalInformatics,聚类,GeneExpression,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GeneTarget,微阵列,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(4年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | WGCNA,flashClust,dynamicTreeCut,联合会,igraph,linkcomm,制程,NMF,biclust,iBBiG,fabia。,BicARE,isa2,s4vd,BiBitR,rqubic,Biobase,PMA统计数据,dbscan,子空间,mclust,宽边帽,ppclust,miRspongeR,Rcpp跑龙套,SummarizedExperiment,GSEABase,org.Hs.eg.db,MatrixCorrelation,能源 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/zhangjunpeng411/miRSM |
BugReports | https://github.com/zhangjunpeng411/miRSM/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | miRSM_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | miRSM_1.16.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | miRSM_1.16.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | miRSM_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRSM |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRSM |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/miRSM/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miRSM/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |