metapod

DOI:10.18129 / B9.bioc.metapod

荟萃分析的假定值差异分析

Bioconductor版本:版本(3.16)

实现了各种方法的假定值相结合微分分析公司的数据集。功能可以结合不同测试假定值相同的分析(例如,在ChIP-seq基因组窗户,外显子在RNA-seq)或相应的测试在单独的分析(例如,复制比较,效果不同的治疗条件)。支持提供处理对数转换输入假定值、缺失值和权重在适当的地方。

作者:亚伦Lun (aut (cre)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“metapod”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“metapod”)

HTML	R脚本	荟萃分析策略
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialPeakCalling,MultipleComparison,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
取决于我
进口我	csaw,mumosa,食物
建议我	TSCAN
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	metapod_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	metapod_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	metapod_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	metapod_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metapod
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ metapod
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/metapod/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/metapod/
包下载报告	下载数据