metabinR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metabinR

丰富和基因组成分基于装箱

Bioconductor版本:版本(3.17)

为执行提供功能丰富和成分装箱基于宏基因组样本,直接从FASTA或FASTQ文件。函数是在Java中实现并通过rJava叫。直接运行的并行实现快速输入FASTA / FASTQ文件执行。

作者:Anestis Gkanogiannis (aut (cre)

维护人员:Anestis Gkanogiannis < Anestis gkanogiannis.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“metabinR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	metabinR
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文本		新闻

细节

biocViews	分类,聚类,微生物组,测序,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2)
进口	方法,rJava
链接
建议	BiocStylecvm,数据。表、dplyr ggplot2、gridExtra knitr, R。rmarkdown跑龙套,sabre、拼写、testthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements	Java (> = 8)
增强了
URL	https://github.com/gkanogiannis/metabinR
BugReports	https://github.com/gkanogiannis/metabinR/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	metabinR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	metabinR_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	metabinR_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	metabinR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabinR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ metabinR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/metabinR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/metabinR/
包下载报告	下载数据