meshr

DOI:10.18129 / B9.bioc.meshr

进行MeSH富集分析的工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

一组注释映射,描述使用来自MeSH的数据组装的整个MeSH。

作者:Tsuyuzaki Koki, Itoshi Nikaido, Gota Morota

维护者:Koki Tsuyuzaki

引用(从R中,输入引用(“meshr”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("meshr")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“meshr”)

超文本标记语言 R脚本 来自BioC 3.14的annotationhub风格的MeSH ORA框架
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释AnnotationData生物信息学FunctionalAnnotationMeSHDbMultipleComparisons软件统计数据
版本 测试盒框
Bioconductor自 BioC 2.14 (R-3.1)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.1.0)
进口 减价rmarkdownBiocStyleknitr,方法,统计,效用,fdrtoolMeSHDbi类别S4VectorsBiocGenericsRSQLite
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/rikenbit/meshr/issues
取决于我
进口我 scTensor
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 meshr_2.4.0.tar.gz
Windows二进制 meshr_2.4.0.zip
macOS二进制(x86_64) meshr_2.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) meshr_2.3.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/meshr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ meshr
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/meshr/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网