Bioconductor版本:发行版(3.16)
mbOmic包包含一组微生物学和代谢组学数据的分析功能,旨在分析微生物学和代谢产物之间的组间相关性。微生物组和代谢组的综合分析是mbOmic的目标。初步实现了利用肠道菌群丰度进行肠型鉴定。
维护人员:congconggong
引用(从R中,输入引用(“mbOmic”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mbOmic")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“mbOmic”)
超文本标记语言 | R脚本 | enterotyping |
超文本标记语言 | R脚本 | 代谢组与微生物组的综合分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 代谢组学,微生物组,网络,软件 |
版本 | 1.2.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.1.0) |
进口 | 平行,doParallel,心理,WGCNA,data.table,igraph,visNetwork,集群,clusterSim,方法,图形,统计 |
链接 | |
建议 | testthat(> = 3.0.0),knitr,rmarkdown,devtools,嫁祸于 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/gongcongcong/mbOmic |
BugReports | https://github.com/gongcongcong/mbOmic/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | mbOmic_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | mbOmic_1.2.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | mbOmic_1.2.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | mbOmic_1.1.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbOmic |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mbOmic |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/mbOmic/ |
包下载报告 | 下载数据 |