马尔
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DOI:10.18129 / B9.bioc.marr
最大秩再现性
Bioconductor版本:发行版(3.16)
marr(最大秩再现性)是一种非参数方法，用于高维生物数据的最大秩统计量检测可再现信号。在这个R包中，我们实现了在高维生物复制实验中测量每个样本对和每个特征的样本对的再现性的函数。该包中用户友好的绘图函数还绘制了每个样本对和每个特征的样本对的再现性直方图。此外，我们的方法还允许用户根据输出可视化检查(直方图)选择用于识别可再现特征和样本对的最佳过滤阈值。这个包还提供了通过可再现特征和/或样本对筛选的数据子集。
作者:Tusharkanti Ghosh [aut, cre]， Max McGrath [aut]， Daisy Philtron [aut]， Katerina kchris [aut]， Debashis Ghosh [aut, cph]
维护:Tusharkanti Ghosh
引文(从R内，输入引用(“马尔”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“马尔”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | marr用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq，MassSpectrometry，代谢组学，质量控制，RNASeq，软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL (>= 3) |
| 取决于 | R (>= 4.0) |
| 进口 | Rcpp，SummarizedExperiment， utils，方法，ggplot2，dplyr，magrittr，rlang，S4Vectors |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat，covr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/Ghoshlab/marr/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | marr_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | marr_1.8.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | marr_1.8.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | marr_1.8.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/marr |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/marr |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/marr/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/marr/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
