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- Bioconductor 3.17
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- loci2path
loci2path
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DOI:10.18129 / B9.bioc.loci2path
Loci2path:监管注释基因间隔基于组织表达法
Bioconductor版本:版本(3.17)
loci2path执行statistics-rigorous浓缩eQTLs基因组分析感兴趣的区域。使用eQTL Genotype-Tissue表达式(GTEx)项目提供的集合,从MSigDB路径集合。
作者:Tianlei徐
维护人员:徐Tianlei < Tianlei。徐:emory.edu >
从内部引用(R,回车引用(“loci2path”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“loci2path”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“loci2path”)
| HTML | R脚本 | loci2path |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BioCarta,报道,FunctionalGenomics,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,测序,软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0) |
| 进口 | pheatmap、wordcloud RColorBrewer,数据。表,方法、grDevices统计数据、图形、GenomicRanges,BiocParallel,S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle、knitr rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/StanleyXu/loci2path |
| BugReports | https://github.com/StanleyXu/loci2path/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | loci2path_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | loci2path_1.20.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | loci2path_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | loci2path_1.19.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/loci2path |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ loci2path |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/loci2path/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/loci2path/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
