iSEEhub

DOI:10.18129 / B9.bioc.iSEEhub

为Bioconductor iSEE ExperimentHub

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包定义了一个定制的着陆页iSEE应用与Bioconductor ExperimentHub。着陆页面允许用户浏览ExperimentHub,选择一个数据集,下载和缓存,并将它直接导入一个Bioconductor iSEE应用。

作者:凯文Rue-Albrecht (aut (cre)

维护人员:凯文Rue-Albrecht < kevinrue67 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“iSEEhub”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“iSEEhub”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“iSEEhub”)

HTML R脚本 导致iSEEhub
HTML R脚本 介绍iSEEhub
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,ImmunoOncology,基础设施,SingleCell,软件
版本 1.1.1
Bioconductor自 BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,ExperimentHub
进口 AnnotationHubBiocManager, DT,iSEE、方法、rintrojsS4Vectors闪亮的、shinydashboard shinyjs跑龙套
链接
建议 BiocStyle,knitr covr RefManageR、rmarkdown sessioninfo, testthat (> = 3.0.0),nullrangesData
SystemRequirements
增强了 BioPlex,biscuiteerData,bodymapRat,CLLmethylation,CopyNeutralIMA,curatedAdipoArray,curatedAdipoChIP,curatedMetagenomicData,curatedTCGAData,DMRcatedata,DuoClustering2018,easierData,emtdata,epimutacionsData,FieldEffectCrc,GenomicDistributionsData,GSE103322,GSE13015,GSE62944,HDCytoData,HMP16SData,HumanAffyData,imcdatasets,mcsurvdata,MetaGxBreast,MetaGxOvarian,MetaGxPancreas,MethylSeqData,muscData,NxtIRFdata,ObMiTi,quantiseqr,restfulSEData,RLHub,sesameData,SimBenchData,SingleCellMultiModal,SingleMoleculeFootprintingData,spatialDmelxsim,STexampleData,TabulaMurisData,TabulaMurisSenisData,TENxVisiumData,tissueTreg,VectraPolarisData,xcoredata
URL https://github.com/iSEE/iSEEhub
BugReports https://support.bioconductor.org/t/iSEEhub
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 iSEEhub_1.1.1.tar.gz
Windows二进制 iSEEhub_1.1.1.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64) iSEEhub_1.1.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iSEEhub
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iSEEhub
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/iSEEhub/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/iSEEhub/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网