iSEEhub

DOI:10.18129 / B9.bioc.iSEEhub

为Bioconductor iSEE ExperimentHub

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包定义了一个定制的着陆页iSEE应用与Bioconductor ExperimentHub。着陆页面允许用户浏览ExperimentHub,选择一个数据集,下载和缓存,并将它直接导入一个Bioconductor iSEE应用。

作者:凯文Rue-Albrecht (aut (cre)

维护人员:凯文Rue-Albrecht < kevinrue67 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“iSEEhub”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“iSEEhub”)

HTML	R脚本	导致iSEEhub
HTML	R脚本	介绍iSEEhub
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,ImmunoOncology,基础设施,SingleCell,软件
版本	1.1.1
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,ExperimentHub
进口	AnnotationHubBiocManager, DT,iSEE、方法、rintrojsS4Vectors闪亮的、shinydashboard shinyjs跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr covr RefManageR、rmarkdown sessioninfo, testthat (> = 3.0.0),nullrangesData
SystemRequirements
增强了	BioPlex,biscuiteerData,bodymapRat,CLLmethylation,CopyNeutralIMA,curatedAdipoArray,curatedAdipoChIP,curatedMetagenomicData,curatedTCGAData,DMRcatedata,DuoClustering2018,easierData,emtdata,epimutacionsData,FieldEffectCrc,GenomicDistributionsData,GSE103322,GSE13015,GSE62944,HDCytoData,HMP16SData,HumanAffyData,imcdatasets,mcsurvdata,MetaGxBreast,MetaGxOvarian,MetaGxPancreas,MethylSeqData,muscData,NxtIRFdata,ObMiTi,quantiseqr,restfulSEData,RLHub,sesameData,SimBenchData,SingleCellMultiModal,SingleMoleculeFootprintingData,spatialDmelxsim,STexampleData,TabulaMurisData,TabulaMurisSenisData,TENxVisiumData,tissueTreg,VectraPolarisData,xcoredata
URL	https://github.com/iSEE/iSEEhub
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/iSEEhub
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	iSEEhub_1.1.1.tar.gz
Windows二进制	iSEEhub_1.1.1.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)	iSEEhub_1.1.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iSEEhub
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iSEEhub
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/iSEEhub/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/iSEEhub/
包下载报告	下载数据