iCNV

DOI:10.18129 / B9.bioc.iCNV

集成的拷贝数变异检测

Bioconductor版本:版本(3.17)

综合拷贝数变异(CNV)检测来自多个平台和实验设计。

作者:张周子路,南希

维修工:子路周< zhouzilu pennmedicine.upenn.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“iCNV”)

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文档

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HTML	R脚本	iCNV装饰图案
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细节

biocViews	CopyNumberVariation,ExomeSeq,HiddenMarkovModel,ImmunoOncology,单核苷酸多态性,软件,WholeGenome
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.3.1),食典委
进口	字段、ggplot2 truncnorm tidyr,数据。表、dplyr grDevices、图形数据,跑龙套,rlang
链接
建议	knitr rmarkdown,WES.1KG.WUGSC
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	iCNV_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	iCNV_1.20.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	iCNV_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	iCNV_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iCNV
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iCNV
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/iCNV/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/iCNV/
包下载报告	下载数据