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- Bioconductor 3.17
- 软件包
- hmdbQuery
hmdbQuery
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DOI:10.18129 / B9.bioc.hmdbQuery
为探索人类代谢组数据库实用工具
Bioconductor版本:版本(3.17)
为探索人类代谢组的数据库定义工具,包括函数来检索特定的代谢物条目和数据快照与成对协会(metabolite-gene,蛋白质,疾病)。
作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >
维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“hmdbQuery”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“hmdbQuery”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“hmdbQuery”)
| HTML | R脚本 | hmdbQuery:与人类代谢组数据库(hmdb.ca) |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 基础设施,代谢组学,软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.5), XML |
| 进口 | S4Vectors、方法、跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,注释,gwascat、testthat rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | hmdbQuery_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | hmdbQuery_1.20.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | hmdbQuery_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | hmdbQuery_1.19.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hmdbQuery |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hmdbQuery |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/hmdbQuery/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/hmdbQuery/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
