hipathia

DOI:10.18129 / B9.bioc.hipathia

HiPathia:高通量途径分析

Bioconductor版本:版本(3.17)

Hipathia是计算的方法从转录组数据的信号转导信号通路。方法是基于迭代算法可以计算出通过一个网络节点的信号强度考虑每一个基因的表达水平和信号的强度。它还提供了一种新方法功能分析允许计算信号到达每个通路的功能注释。

作者:玛尔塔·r·伊达尔戈(aut (cre),何塞Carbonell-Caballero[所有],旧金山Salavert[所有],艾丽西亚Amadoz[所有],Cankut Cubuk[所有],华金Dopazo(施)

维修工:玛尔塔·r·伊达尔戈<玛尔塔。伊达尔戈在outlook.es >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“hipathia”)

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文档

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PDF	R脚本	Hipathia包
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文本		新闻

细节

biocViews	去,GeneExpression,GeneSignaling,GraphAndNetwork,通路,软件
版本	3.0.2
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.1), igraph (> = 1.0.1),AnnotationHub(> = 2.6.5),MultiAssayExperiment(> = 1.4.9),SummarizedExperiment(> = 1.8.1)
进口	硬币,统计数据,limmagrDevices跑龙套,图形,preprocessCoreservr,DelayedArray、matrixStats、方法S4Vectors宠物猫,ggpubr ggplot2 dplyr, visNetwork, reshape2 MetBrewer
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	hipathia_3.0.2.tar.gz
Windows二进制	hipathia_3.0.2.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	hipathia_3.0.2.tgz
macOS二进制(arm64)	hipathia_3.0.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hipathia
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hipathia
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/hipathia/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hipathia/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.17源码包	源存档