healthyControlsPresenceChecker

DOI:10.18129 / B9.bioc.healthyControlsPresenceChecker

从GEO下载基因表达数据集，并检查它是否包含健康对照的数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

一种函数，用于读入基因表达数据集的GEO登录代码，从GEO检索其数据，并检查数据集中是否存在健康对照的数据。如果找到健康的控件数据，则返回true，否则返回false。基因表达综合。ID:标识码。GEO数据集从URL下载．

作者:Davide Chicco [aut, cre]

维护者:Davide Chicco < Davide。Chicco在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager")::install("healthyControlsPresenceChecker")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“healthyControlsPresenceChecker”)

超文本标记语言	R脚本	healthyControlsPresenceChecker装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，ExpressionData，地理，RepositoryData
版本	1.2.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0.0)
进口	xml2，GEOquery，geneExpressionFromGEO，magrittr
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，减价，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/davidechicco/healthyControlsPresenceChecker
BugReports	https://github.com/davidechicco/healthyControlsPresenceChecker/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	healthyControlsPresenceChecker_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/healthyControlsPresenceChecker
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/healthyControlsPresenceChecker
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/healthyControlsPresenceChecker/
软件包下载报告	下载数据