杂环胺

DOI:10.18129 / B9.bioc.hca

探索人类细胞图谱数据协调平台

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包为用户提供了查询人类细胞图谱数据存储库的单细胞实验数据的能力。' projects() '， ' files() '， ' samples() '和' bundles() '函数检索这些索引的摘要信息;对应的' *_details() '可用于每个索引的单个条目。可以使用' files_download() '下载基于文件的资源。该包的高级使用允许用户对大型结果集进行分页，并灵活地查询表示查询响应的“列表的列表”结构。

作者:Maya McDaniel [aut]， Martin Morgan [aut, cre]

维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (hca)

超文本标记语言	R脚本	访问人类细胞图谱数据
超文本标记语言	R脚本	研究人类细胞图谱
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	SingleCell，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.1)
进口	httr，jsonlite，dplyr，宠物猫，tidyr，readr，BiocFileCache，工具，utils，消化，闪亮的，miniUI，DT
链接
建议	LoomExperiment，SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，S4Vectors、方法、testthat(> = 3.0.0),knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	hca_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	hca_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	hca_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	hca_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hca
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/hca
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/hca/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hca/
软件包下载报告	下载数据