- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- gwasurvivr
gwasurvivr
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DOI:10.18129 / B9.bioc.gwasurvivr
gwasurvivr: R包基因组广泛的生存分析
Bioconductor版本:版本(3.17)
gwasurvivr包进行生存分析使用Cox比例风险模型估算遗传数据。
作者:阿巴斯Rizvi, Ezgi Karaesmen马丁·摩根,劳拉Sucheston-Campbell
维护人员:阿巴斯Rizvi < aarizv gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“gwasurvivr”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gwasurvivr”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“gwasurvivr”)
| HTML | R脚本 | gwasurvivr装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiomedicalInformatics,GeneticVariability,遗传学,GenomeWideAssociation,药物基因组学,回归,单核苷酸多态性,软件,生存 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.4.0) |
| 进口 | GWASTools生存,VariantAnnotation、平行、matrixStatsSummarizedExperiment,统计,跑龙套,SNPRelate |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle、knitr rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/suchestoncampbelllab/gwasurvivr |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | gwasurvivr_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gwasurvivr_1.18.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | gwasurvivr_1.18.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | gwasurvivr_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwasurvivr |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gwasurvivr |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/gwasurvivr/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gwasurvivr/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
