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ggtreeExtra
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ggtreeExtra
在圆形或其他布局树“ggtree”上添加几何图层的R包
Bioconductor版本:发行版(3.16)
'ggtreeExtra'扩展了使用'ggtree'在系统发育树上映射和可视化相关数据的方法。这些相关数据可以在外部面板上显示为圆形布局、扇形布局或其他由'ggtree'使用'ggplot2'语法构建的矩形布局树。
作者:徐双斌[aut, cre]
，于广创[aut, ctb]
维护人员:徐双斌< x双斌at 163.com>
引文(从R内，输入引用(“ggtreeExtra”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“ggtreeExtra”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | ggtreeExtra |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释，系统发生学，软件，可视化 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL (>= 3) |
| 取决于 | |
| 进口 | ggplot2跑龙套,rlang，ggnewscale统计数据,ggtree，tidytree(> = 0.3.9) |
| 链接 | |
| 建议 | treeio，ggstar，拼接而成，knitr，rmarkdown，prettydoc，减价，testthat(> = 3.0.0),支柱 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra/ |
| BugReports | https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | MicrobiotaProcess |
| 建议我 | enrichplot，ggmsa |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | ggtreeExtra_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ggtreeExtra_1.8.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | ggtreeExtra_1.8.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | ggtreeExtra_1.7.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtreeExtra |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ggtreeExtra |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ggtreeExtra/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
