ggtreeDendro

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggtreeDendro

画“系统树图”使用“ggtree”

Bioconductor版本:版本(3.17)

提供了一组“autoplot”方法来可视化树状结构(例如,层次聚类和分类回归树)使用“ggtree”。你可以调整图形参数使用图形语法和整合外部数据的语法树。

作者:Guangchuang Yu (cre, aut cph]许,Shuangbin(施)张,Chuanjie(施)

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ggtreeDendro”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ggtreeDendro”)

HTML	R脚本	使用ggtree可视化系统树图
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类,聚类,DecisionTree,系统发生学,软件,可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	ggtree(> = 3.5.3)
进口	统计,ggplot2 tidytree跑龙套
链接
建议	aplot,集群、knitr质量、mdendro prettydoc, pvclust, rmarkdown, testthat (> = 3.0.0),treeio,yulab.utils
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ggtreeDendro_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	ggtreeDendro_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ggtreeDendro_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	ggtreeDendro_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtreeDendro
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggtreeDendro
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ggtreeDendro/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ggtreeDendro/
包下载报告	下载数据