ggcyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggcyto

用ggplot可视化细胞计数数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

通过对flowSet、ncdfFlowSet和GatingSet类实现的专用强化方法，可以直接使用ggplot绘制原始和门控流式细胞术数据。Ggcyto包装器和一些自定义层也可以很容易地将门和人口统计信息添加到图中。

作者:Mike Jiang

维护者:Mike Jiang < Mike at ozette.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ggcyto”)

超文本标记语言	R脚本	ggcyto的特性摘要
超文本标记语言	R脚本	细胞术数据快速绘图
超文本标记语言	R脚本	使用ggcyto可视化flowSet
超文本标记语言	R脚本	使用ggcyto可视化GatingSet
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，FlowCytometry，ImmunoOncology，基础设施，软件，可视化
版本	1.26.4
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	文件许可证
取决于	方法,ggplot2(> = 3.3.0),flowCore(> = 1.41.5),ncdfFlow(> = 2.17.1),flowWorkspace(> = 3.33.1)
进口	plyr，尺度，hexbin，data.table，RColorBrewer，gridExtra，rlang
链接
建议	testthat，flowWorkspaceData，knitr，rmarkdown，flowStats，openCyto，flowViz，ggridges，vdiffr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RGLab/ggcyto/issues
全靠我
进口我	CytoML
建议我	催化剂，flowCore，flowStats，flowWorkspace，openCyto
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ggcyto_1.26.4.tar.gz
Windows二进制	ggcyto_1.26.4.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ggcyto_1.26.4.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ggcyto_1.26.4.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggcyto
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ggcyto
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ggcyto/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ggcyto/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.16的旧源包	源存档