fobitools

DOI:10.18129 / B9.bioc.fobitools

FOBI本体的操作工具

Bioconductor版本:版本(3.16)

一组工具与Food-Biomarker本体(FOBI)进行交互。生物意义的一组基本操作工具分析、图形和文本挖掘注释营养策略数据。

作者:波尔Castellano-Escuder (aut (cre)Cristina Andres-Lacueva (aut),亚历克斯Sanchez-Pla (aut)

维护人员:波尔Castellano-Escuder < polcaes gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“fobitools”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fobitools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“fobitools”)

HTML R脚本 饮食文本注释
HTML R脚本 简单的食物奥拉
HTML R脚本 用例ST000291
HTML R脚本 用例ST000629
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释,BiomedicalInformatics,Cheminformatics,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,MassSpectrometry,代谢组学,通路,软件,可视化
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 4.1)
进口 clisymbols,蜡笔,dplyr,fgsea,ggplot2,ggraph,magrittr,ontologyIndex,purrr,RecordLinkage,stringr,textclean,发出滴答声,tidygraph,tidyr,发呜呜声
链接
建议 BiocStyle,covr,ggrepel,kableExtra,knitr,metabolomicsWorkbenchR,POMA,rmarkdown,房车,SummarizedExperiment,testthat2.3.2 (> =)tidyverse
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/
BugReports https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 fobitools_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 fobitools_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) fobitools_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) fobitools_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fobitools
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fobitools
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/fobitools/
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