Bioconductor版本:版本(3.16)
一组工具与Food-Biomarker本体(FOBI)进行交互。生物意义的一组基本操作工具分析、图形和文本挖掘注释营养策略数据。
作者:波尔Castellano-Escuder (aut (cre)Cristina Andres-Lacueva (aut),亚历克斯Sanchez-Pla (aut)
维护人员:波尔Castellano-Escuder < polcaes gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“fobitools”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fobitools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“fobitools”)
HTML | R脚本 | 饮食文本注释 |
HTML | R脚本 | 简单的食物奥拉 |
HTML | R脚本 | 用例ST000291 |
HTML | R脚本 | 用例ST000629 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,BiomedicalInformatics,Cheminformatics,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,MassSpectrometry,代谢组学,通路,软件,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 4.1) |
进口 | clisymbols,蜡笔,dplyr,fgsea,ggplot2,ggraph,magrittr,ontologyIndex,purrr,RecordLinkage,stringr,textclean,发出滴答声,tidygraph,tidyr,发呜呜声 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,covr,ggrepel,kableExtra,knitr,metabolomicsWorkbenchR,POMA,rmarkdown,房车,SummarizedExperiment,testthat2.3.2 (> =)tidyverse |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/ |
BugReports | https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | fobitools_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | fobitools_1.6.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | fobitools_1.6.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | fobitools_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fobitools |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fobitools |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/fobitools/ |
包下载报告 | 下载数据 |