flowSpecs

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowSpecs

处理高维细胞术数据的工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包旨在填补传统的细胞术预处理软件的作用，用于光谱分解、转换、可视化和清理，并通过启用流帧和流集到数据帧的转换，帮助进一步的下游分析，如DepecheR。flowcore兼容的自动1d门控/过滤功能在管道中。软件包的名称已经被选择，因为它将处理光谱细胞术，因为它将希望给用户一个漂亮的眼镜，通过它来查看他们的数据。

作者:Jakob理论家[au, cre]

维护者:Jakob定理< Jakob。在ki.se theorell >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("flowSpecs")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“flowSpecs”)

超文本标记语言	R脚本	处理原始谱细胞术文件的示例工作流
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，归一化，SingleCell，软件，可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	ggplot2(> = 3.1.0),BiocGenerics(> = 0.30.0),BiocParallel(> = 1.18.1),Biobase(> = 2.48.0),reshape2(> = 3),flowCore(> = 1.50.0),动物园(>= 1.8.6)， stats (>= 3.6.0)， methods (>= 3.6.0)
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，服饰
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/jtheorell/flowSpecs/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	flowSpecs_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	flowSpecs_1.12.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	flowSpecs_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64)	flowSpecs_1.11.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowSpecs
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowSpecs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowSpecs/
包下载报告	下载数据