ewceData

DOI:10.18129 / B9.bioc.ewceData

ewceData提供了ewce所需的参考数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

此包提供了ewce所需的参考数据。表达加权细胞类型富集(EWCE)用于确定哪些细胞类型在基因列表中富集。该软件包提供了测试简单基因列表(如人类疾病相关基因)和差异表达研究结果的富集性的工具。该软件包不依赖于任何特定的单细胞转录组数据集，用户定义的数据集可以加载并用于分析。

作者:Alan Murphy [cre]，内森·斯基恩[au]

维护者:Alan Murphy

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ewceData”)

超文本标记语言	R脚本	表达加权细胞型富集EWCE的数据包
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，ExpressionData，基因组，MicroarrayData，蛋白质组，RNASeqData，SequencingData，SingleCellData
版本	1.6.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1)，ExperimentHub
进口
链接
建议	knitr，BiocStyle，ggplot2，cowplot，rmarkdown，减价，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/neurogenomics/ewceData
全靠我
进口我	EWCE
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ewceData_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ewceData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ewceData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ewceData/
软件包下载报告	下载数据