epiNEM

DOI:10.18129 / B9.bioc.epiNEM

epiNEM

Bioconductor版本:发行版(3.16)

epiNEM是原始嵌套效应模型(NEM)的扩展。EpiNEM能够考虑双重敲除,并推断出更复杂的网络信号通路。它是为大规模双淘汰屏幕量身定制的。

作者:Madeline Diekmann & Martin Pirkl

维护者:Martin Pirkl

引文(从R内,输入引用(“epiNEM”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“epiNEM”)

超文本标记语言 R脚本 epiNEM
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 网络NetworkInference通路软件SystemsBiology
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 4.1)
进口 BoolNete1071gtools统计数据,igraph跑龙套,晶格latticeExtraRColorBrewerpcalgminetgrDevices,mnemlatex2exp
链接
建议 knitrRUnitBiocGenericsSTRINGdbdevtoolsrmarkdownGOSemSimAnnotationHuborg.Sc.sgd.db
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/
BugReports https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/issues
全靠我
进口我 bnemdcenempi
建议我 mnem
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 epiNEM_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 epiNEM_1.22.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) epiNEM_1.22.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) epiNEM_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epiNEM
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/epiNEM/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/epiNEM/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网