富集
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doi：10.18129/b9.bioc.enrichplot
功能富集结果的可视化
生物导体版本：版本（3.15）
“富集”软件包实现了几种可视化方法，以解释从ORA或GSEA分析获得的功能富集结果。它主要设计用于使用“ ClusterProfiler”套件套件。所有可视化方法都是基于“ GGPLOT2”图形开发的。
作者：广琴Yu [AUT，CRE]
，Erqiang Hu [CTB]
维护者：gmail.com> guangchuang yu
引用（从r内，输入引用（“富集”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ EnrichPlot”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“富集”）
| html | 富集 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，去，，，，基因烯，，，，kegg，，，，途径，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.16.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（4年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | 剧情，，，，剂量（> = 3.16.0），GGPLOT2，，，，ggraph，图形，网格，Igraph， 方法，plyr，，，，purrr，，，，rcolorbrewer，，，，RESHAPE2，统计，utils，散落，，，，阴影文本，，，，Gosemsim，，，，马格里特，，，，格特里，，，，Yulab.utils（> = 0.0.4） |
| 链接 | |
| 建议 | clusterProfiler，，，，dplyr，，，，EUROPEPMC，，，，ggupset，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，org.hs.eg.db，，，，Prettydoc，，，，蒂布尔，，，，花花公子，，，，GGFORCE，，，，AnnotationDbi，，，，ggplotify，，，，Ggridges，grdevices，栅格，，，，ggnewscale，，，，Ggrepel（> = 0.9.0），GGSTAR，，，，树，，，，秤，，，，tidytree，，，，rlang，，，，GGTREEEXTRA，，，，tidydr |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/ |
| BugReports | https://github.com/guangchuangyu/enrichplot/issues |
| 取决于我 | Maendtoend |
| 进口我 | Chipseeker，，，，clusterProfiler，，，，碎片器，，，，Exphuntersuite，，，，Mageckflute，，，，网眼，，，，微生物组合器，，，，多方，，，，Reactomepa |
| 建议我 | 甲基，，，，Pareg |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | EnrichPlot_1.16.1.tar.gz |
| Windows二进制 | enrichplot_1.16.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | EnrichPlot_1.16.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichplot |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/enrichplot |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/enrichplot/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.15的旧源软件包 | 来源存档 |
