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drugTargetInteractions
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DOI:10.18129 / B9.bioc.drugTargetInteractions
药物相互作用
Bioconductor版本:发行版(3.16)
提供用于识别小分子或基因/蛋白质标识符集的药物-靶点相互作用的实用程序。所需的药物-靶点相互作用信息从ChEMBL数据库的本地SQLite实例获得。ChEMBL被选择用于此目的，因为它为公共领域的药物靶点信息提供了最全面和最好的注释知识资源之一。
作者:Thomas Girke [cre, aut]
维护者:Thomas Girke < Thomas。Girke在ucr.edu>
引文(从R内，输入引用(“drugTargetInteractions”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“drugTargetInteractions”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 药物相互作用 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiomedicalInformatics，Cheminformatics，代谢组学，遗传药理学，药物基因组学，蛋白质组学，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | 方法，R (>= 4.1) |
| 进口 | 跑龙套,RSQLite，UniProt.ws，biomaRt，ensembldb，BiocFileCache，dplyr，rappdirs，AnnotationFilter，S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit，BiocStyle，knitr，rmarkdown，ggplot2，reshape2，DT，EnsDb.Hsapiens.v86 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions |
| BugReports | https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | drugTargetInteractions_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | drugTargetInteractions_1.6.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | drugTargetInteractions_1.6.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | drugTargetInteractions_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drugTargetInteractions |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/drugTargetInteractions |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/drugTargetInteractions/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/drugTargetInteractions/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
