drawProteins

DOI:10.18129 / B9.bioc.drawProteins

蛋白质包画图表从Uniprot API输出

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包蛋白质图表来自Uniprot API输出。从JSON返回的命令,它会创建一个dataframe Uniprot功能的API。这个几何学dataframe可以使用基于ggplot2和基础R蛋白示意图。

作者:保罗•布伦南(aut (cre)

维修工:保罗·布伦南在gmail.com < brennanpincardiff >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“drawProteins”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“drawProteins”)

HTML	R脚本	使用drawProteins
HTML	R脚本	使用extract_transcripts drawProteins
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	FunctionalPrediction,蛋白质组学,软件,可视化
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	ggplot2、httr dplyr、readr tidyr
链接
建议	covr、testthat knitr rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins
BugReports	https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins/issues/new
取决于我
进口我	factR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	drawProteins_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	drawProteins_1.20.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	drawProteins_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	drawProteins_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drawProteins
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ drawProteins
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/drawProteins/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/drawProteins/
包下载报告	下载数据