多萝西娅

DOI:10.18129 / B9.bioc.dorothea

人类和老鼠TF规则的集合

Bioconductor版本:发行版(3.16)

DoRothEA是一个包含有符号转录因子(TF) -靶基因相互作用的基因调控网络。调控，TF及其转录靶点的收集，是从人类和小鼠的不同类型的证据中策划和收集的。根据支持证据的数量，为每个tf -靶标相互作用分配一个置信水平。

作者:Daniel Dimitrov [cre]——克里斯蒂安·h·霍兰德[au]，卢兹·加西亚-阿隆索[aut]，阿尔贝托·巴尔代奥利瓦斯[ctb]，米努·阿什蒂亚尼[ctb]，阿提拉·加博尔[ctb]

维护者:Daniel Dimitrov < Daniel。迪米特洛夫在海德堡大学>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("dorothea")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“多萝西娅”)

超文本标记语言	R脚本	多萝西娅调节子。
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData，Homo_sapiens_Data，Mus_musculus_Data
版本	1.10.0
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 4.0)
进口	dplyr，magrittr，bcellViper，毒蛇
链接
建议	Biobase，BiocStyle，knitr，pheatmap，pkgdown，rmarkdown，修拉，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，testthat(> =魅惑,宠物猫，tidyr,跑龙套
SystemRequirements
增强了
URL	https://saezlab.github.io/dorothea/https://github.com/saezlab/dorothea
BugReports	https://github.com/saezlab/dorothea/issues
全靠我
进口我	cosmosR，更容易
建议我	MethReg
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	dorothea_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dorothea
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dorothea
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dorothea/
软件包下载报告	下载数据