多萝西娅

DOI:10.18129 / B9.bioc.dorothea

人类和老鼠TF规则的集合

Bioconductor版本:发行版(3.16)

DoRothEA是一个包含有符号转录因子(TF) -靶基因相互作用的基因调控网络。调控,TF及其转录靶点的收集,是从人类和小鼠的不同类型的证据中策划和收集的。根据支持证据的数量,为每个tf -靶标相互作用分配一个置信水平。

作者:Daniel Dimitrov [cre]——克里斯蒂安·h·霍兰德[au],卢兹·加西亚-阿隆索[aut],阿尔贝托·巴尔代奥利瓦斯[ctb],米努·阿什蒂亚尼[ctb],阿提拉·加博尔[ctb]

维护者:Daniel Dimitrov < Daniel。迪米特洛夫在海德堡大学>

引文(从R内,输入引用(“多萝西娅”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("dorothea")

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文档

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browseVignettes(“多萝西娅”)

超文本标记语言 R脚本 多萝西娅调节子。
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文本 许可证

细节

biocViews ExperimentDataHomo_sapiens_DataMus_musculus_Data
版本 1.10.0
许可证 GPL-3 +文件许可证
取决于 R (>= 4.0)
进口 dplyrmagrittrbcellViper毒蛇
链接
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SystemRequirements
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URL https://saezlab.github.io/dorothea/https://github.com/saezlab/dorothea
BugReports https://github.com/saezlab/dorothea/issues
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源包 dorothea_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dorothea
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dorothea
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/dorothea/
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