截然不同的

DOI:10.18129 / B9.bioc.distinct

Distinct:一种通过层次排列测试进行差异分析的方法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

Distinct是一种统计方法，用于在两个或多个分布组之间进行差异测试;差分测试是通过对每个样本的累积分布函数(cdfs)进行分层非参数排列测试。虽然大多数差分表达方法的目标是条件之间平均丰度的差异，但通过比较完整的cdfs，可以同时识别涉及均值变化的差分模式，以及不涉及均值的更微妙的变化(例如，具有相同均值的单峰分布与双峰分布)。Distinct是一种通用且灵活的工具:由于其完全非参数性质，即不假设数据是如何生成的，因此它可以应用于各种数据集。它特别适合于对单细胞数据进行差异状态分析(即细胞亚群内的差异分析)，如单细胞RNA测序(scRNA-seq)和高维流式或大规模细胞术(HDCyto)数据。要使用不同的样本，需要来自两组或两组以上样本(即实验条件)的数据，每组至少2个样本(即生物重复)。

作者:Simone Tiberi [aut, cre]。

维护者:Simone Tiberi < Simone。提比利在uzh.ch>

安装

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如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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超文本标记语言	R脚本	Distinct:一种通过层次排列测试进行差异分析的方法
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细节

biocViews	DifferentialExpression，FlowCytometry，GeneExpression，GeneTarget，遗传学，MultipleComparison，RNASeq，测序，SingleCell，软件，StatisticalMethod，转录，可视化
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 4.0)
进口	Rcpp，Rfast统计数据,SummarizedExperiment，SingleCellExperiment、方法、矩阵，foreach平行,doParallel，doRNG，ggplot2，limma，嘘
链接	Rcpp，RcppArmadillo，Rfast
建议	knitr，rmarkdown，testthat，UpSetR
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/SimoneTiberi/distinct
BugReports	https://github.com/SimoneTiberi/distinct/issues
全靠我
进口我	调味品
建议我	spatialHeatmap
链接到我
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包档案

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源包	distinct_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	distinct_1.10.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	distinct_1.10.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	distinct_1.9.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/distinct
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/distinct
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/distinct/
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