diffuStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffuStats

生物网络的扩散评分

Bioconductor版本:发行版(3.16)

标签传播方法是计算生物学中广泛使用的一种方法，它利用网络数据为分子实体提供上下文。节点标签可以从基因表达、全基因组关联研究、蛋白质结构域或代谢组学分析中获得，它们被传播到网络中的相邻节点，通过先前注释的知识有效地平滑分数，并优先考虑新的候选节点。R包diffuStats包含一组扩散核和评分方法，以促进它们的计算、表征和基准测试。

作者:Sergio Picart-Armada [aut, cre]， Alexandre Perera-Lluna [aut]

维护者:Sergio Picart-Armada

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("diffuStats")

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文档

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browseVignettes(“diffuStats”)

PDF	R脚本	案例研究:预测蛋白质功能
超文本标记语言	R脚本	快速启动
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，遗传学，GenomeWideAssociation，GraphAndNetwork，代谢组学，网络，归一化，蛋白质组学，软件，转录组
版本	1.18.0
在Bioconductor公司	BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	grDevices，统计，方法，矩阵，质量，使彻底失败，expm，igraph，Rcpp，RcppArmadillo，RcppParallel，plyr，precrec
链接	Rcpp，RcppArmadillo，RcppParallel
建议	testthat，knitr，rmarkdown，ggplot2，ggsci，igraphdata，BiocStyle，reshape2,跑龙套
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	diffuStats_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	diffuStats_1.18.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	diffuStats_1.18.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	diffuStats_1.18.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/diffuStats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/diffuStats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/diffuStats/
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