diffcyt

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffcyt

通过高分辨率的集群在高维微分发现血细胞计数

Bioconductor版本:版本(3.17)

统计方法在高维微分分析发现血细胞计数数据(包括流式细胞仪、血细胞计数质量或CyTOF, oligonucleotide-tagged血细胞计数),基于高分辨率的结合集群和经验贝叶斯主持测试改编自转录组。

作者:卢卡斯·m·韦伯(aut (cre)

维护人员:卢卡斯·m·韦伯在gmail.com < lukas.weber.edu >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“diffcyt”)

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HTML	R脚本	diffcyt工作流
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays,CellBiology,聚类,FeatureExtraction,FlowCytometry,ImmunoOncology,蛋白质组学,SingleCell,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	flowCore,FlowSOM,SummarizedExperiment,S4Vectors,limma,刨边机,multcomp lme4 dplyr、tidyr reshape2, magrittr,属性,方法,跑龙套,grDevices,图形,ComplexHeatmapcirclize,网格
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr testthat,HDCytoData,催化剂
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/diffcyt
BugReports	https://github.com/lmweber/diffcyt/issues
取决于我	censcyt,cytofWorkflow
进口我	CyTOFpower,treekoR
建议我	催化剂
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	diffcyt_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	diffcyt_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)	diffcyt_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	diffcyt_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffcyt
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ diffcyt
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/diffcyt/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/diffcyt/
包下载报告	下载数据