举起

doi:10.18129/b9.bioc.liftover

这是发展升降机的版本;对于稳定版本,请参阅举起

用Rtracklayer更改基因组坐标系:: Liftover

生物导体版本:开发(3.16)

与UCSC浏览器轨道基础架构共同开发的升力设施可用于以Granges格式转换数据。此处用EBI/NHGRI GWAS目录的图像进行了说明,该图像截至2017年5月10日,它与NCBI Build HG38定义的坐标分发。

作者:生物导体软件包维护器[AUT,CRE]

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“举重”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ liffover”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“举重”)

html R脚本 用Rtracklayer更改基因组坐标系:: Liftover

细节

生物浏览 BasicWorkFlow,,,,工作流程
版本 1.21.0
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3.0),Gwascat,,,,基因组机,,,,rtracklayer,,,,同性恋,,,,生物基因
进口
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/liftover/
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 liftover_1.21.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/liftover
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/举升
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/liftover/
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