RNAseq123

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAseq123

这是发展RNAseq123版本;稳定的发布版本,请参阅RNAseq123。

RNA-seq分析很容易与limma 1-2-3, Glimma和磨边机

Bioconductor版本:发展(3.17)

R包支持F1000Research工作流使用limma RNA-seq分析文章,Glimma受法律和磨边机等。(2016)。

作者:慈善法,代孕妈妈Alhamdoosh Shian苏,Xueyi咚,Luyi田,戈登史密斯和马修·里奇

维护人员:马修·里奇在wehi.edu.au > < mritchie

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“RNAseq123”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RNAseq123”)

HTML	R脚本	指导创建设计矩阵基因表达实验(英文版本)
HTML	R脚本	RNA-seq分析很容易与limma 1-2-3, Glimma和磨边机(中国版)
HTML	R脚本	RNA-seq分析很容易与limma 1-2-3, Glimma和磨边机(英文版本)

细节

biocViews	GeneExpressionWorkflow,ImmunoOncologyWorkflow,工作流
版本	1.23.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.0),Glimma(> = 1.1.9),limma,刨边机,gplots,RColorBrewer,Mus.musculus,R.utils,TeachingDemos,statmod,BiocWorkflowTools
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://f1000research.com/articles/5-1408/v3
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RNAseq123_1.23.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseq123
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAseq123
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAseq123/
包下载报告	下载数据