curatedOvarianData是卵巢癌转录组临床研究的综合资源。它提供了2970例患者的24个表达数据集,包括癌症基因组图谱(TCGA) microRNA和Affymetrix mRNA微阵列数据集。用最新的图谱将探测集映射到官方的基因符号上。所有临床注释都是手工整理和机器检查的,以确保语法一致并最大限度地保留可用的临床变量,从而获得近1500名患者的总生存期、分期、分级和组织学信息。ExpressionSet槽中填充了大量元数据,包括PubMed id、引用、摘要、针对撤回和重复样本的特定研究警告,以及probeset <——>基因图。包小插图提供了一些示例,用于根据灵活的规则选择患者和数据集,执行潜在生物标记的元分析,从ExpressionSet元数据创建可发布的表,以及为非r用户简单导出数据表。